上海自贸区申办进出口权流程如下：
1、首先是需要确认营业执照上是否有“进出口”或“货物及技术进出”等关于进出口的字样，如没有就需要先进行营业执照的变更。
2、到外经贸局外贸科进行备案，领取《对外贸易经营者备案登记表》。
3、备案需要提交如下材料：
(1)网上提交打印的《对外贸易运营者备案登记表》;
(2)变更后的破产执照复印件;
(3)个体工商户须提交合法公证机构出具的财富公证证明(本件);
(4)外资企业需要先变更破产执照及核准证书，再提交由合法公证机构出具的资金信用证明文件(原件)。
4、到上海海关科技大楼进行备案，办理进出口货物收发货人注册登记。领取《报关单位注册登记证书》。
5、到电子口岸窗口办理法人卡、操作员卡等。
6、到检验检疫局进行备案，领取《自理报检单位备案登记证明书》。
7、到外汇管理局进行名录登记，同时要进行的还有外汇账户的开立。
8、先到所在地公安局备案，最后刻报关专业章。
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