1、在交纳税种上：
个体户：只要个人所得税，增值税，不交企业所得税，个体户月销售额未超过10万元即季销售额不超过30万元的，免交增值税，这和企业相同，个体户出资人对企业债务承担连带责任。
有限公司：企业要交企业所得税、个人所得税、增值税，其中增值税和个体户增值税规则相同，企业所得税根据营业额计算，这也是区别个体户的最主要的区别，有限公司的投资人对公司按出资承担有限责任。企业一般是根据企业的经济性质和经营的业务来确定企业应缴纳的税种和税率的。
（1）从事生产、销售、修理修配的的企业一般要交增值税的，增值税的纳税人分为增值税一般纳税人与小规模纳税人(新设立的企业都是小规模纳税人)。
（2）从事提供应税劳务(餐饮、服务、广告、运输、咨询等等)、转让无形资产或销售不动产的企业要缴纳营业税。营业税的税率根据行业不同，从3%到5%，个别的行业20%，如网吧等。营业税在地税缴纳。
2.在交税方式上
个体户一般是税务的机关根据其所在位置规模员工人数销售商品等等来估算你的销售额,然后再给定税.不论当月的收入多少，有无收入都要按定税的金额来交税，个体工商户为定额税由税务专管员根据以上的情况核定。
有限责任公司：则是通常要求企业必须核算健全,要有帐,交税也是根据企业自己申报的收入来交税，每月要按时记账纳税。
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