1、根据《税收征收管理法》第二十五条规定，纳税人必须依照法律、行政法规规定或者税务机关依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容，如实办理纳税申报，报送纳税申报表、财务会计报表以及根据实际需要要求报送的其他纳税资料。
2、《中华人民共和国税收征收管理法》第六十二条规定，纳税人未按照规定的期限办理纳税申报和报送纳税资料的，或者扣缴义务人未按照规定的期限向税务机关报送代扣代缴、代收代缴税款报告表和有关资料的，由税务机关责令限期改正，可以处二千元以下的罚款;情节严重的，可以处二千元以上一万元以下的罚款。
3、根据上述规定，未按规定的期限进行纳税申报，税务机关对贵公司可处二千元以下的罚款;情节严重的，可以处二千元以上一万元以下的罚款。
4、个人所得税计算方法：
征缴个人所得税的计算方法，个人所得税费用扣除标准原来是2000，十一届全国人大常委会第二十一次会议27日再次审议个人所得税法修正案草案，草案维持一审时“工资、薪金所得减除费用标准从2000元提高至3500元”的规定，同时将个人所得税第1级税率由5%修改为3%。使用超额累进税率的计算方法如下：
（1）缴税=全月应纳税所得额*税率-速算扣除数。
（2）全月应纳税所得额=(应发工资-四金)-3500。
（3）实发工资=应发工资-四金-缴税。
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