1、由于登记手续费是按资金百分比计算的，所以登记基金较多，办理登记手续的费用较高。工商业虽然是免费的，但仍按注册基金征收印花税。
2、公司注册资本越高，承担的民事责任越大。
3、注册基金的数量，在一定程度上，公司的资金是否雄厚，是否有能力做大项目，客户有时会把注册基金作为一种合作考虑；
4、许多竞争性投标项目都是为了检验公司的注册资金，由于注册资本涉及到贵公司的资格评定等级，所以具有不同资质等级的公司的项目等级可以获得投标，就像三级建筑资质企业不能获得500万的项目投标资格一样，注册资本小于一定规模，甚至没有资格参与投标。
5、在许多行业注册时，都有注册资本门槛的要求，注册资本不足以申请银行名称的公司注册。例如，劳务派遣公司的最低注册资本为200万元，没有200万元就不能注册。
一般来说，差别不大，公司注册需要满足最低注册资本要求，但改革后，有限责任公司的注册资本没有最低限额。目前，为了获得我国金融机构的贷款，公司必须有一定的自有资金。金融机构判断公司自有资金的标准之一是查看公司的注册资金。因此，为了筹集更多的资金，注册基金仍然要比较容易操作。登记手续的费用只按基金的百分比计算，因此注册基金较多，办理登记手续的费用较高。
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